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mimic3 2

인턴일지🥕 MIMIC-III .1 Data Generation 을 해보자

따라한 코드는 github.com/YerevaNN/mimic3-benchmarks YerevaNN/mimic3-benchmarks Python suite to construct benchmark machine learning datasets from the MIMIC-III clinical database. - YerevaNN/mimic3-benchmarks github.com 1. git clone 2. MIMIC-III CSV에서 각 SUBJECT_ID 별로 폴더 생성해 파일로 저장. ICU stay information: data/{SUBJECT_ID}/stays.csv diagnoses : data/{SUBJECT_ID}/diagnoses.csv events : data/{SUBJECT_ID}/e..

인턴일지🥕 MIMIC-III 0. 데이터 권한 얻기 ( Using Clinical Notes with Time Series Data for ICU Mana

인턴을 지원했고 교수님이 연구 시작 전 세미 과제처럼 내주신 논문을 직접 실행해보기로 했다. arxiv.org/pdf/1909.09702.pdf 교수님이 논문과 코드를 함께 보내주셨다. 무작정 코드를 따라해 보려하는데 처음에는 코랩에서 시도해도 안되고 로컬에서도 안돌아가서 뭔가 이상한데..? 싶었다. 역시 이번에도 이상한 것은 나였다 ^.^ 이 코드를 실행하는데 계속 에러가 나는 거다.. 대체 뭐냐;;;하다가 알고보니 mimic-iii(mimic3) 데이터는 따로 다운받아야 하는 것이었다. 아무래도 연구 논문 주제가 중환자실 데이터를 이용하다보니 데이터 사용시의 교육을 받고 승인 절차를 따라서 데이터를 제공받았다. 참고한 사이트는 아래와 같다. www.notion.so/2-2-ad9d27f8044a46a..